Архив номеров журнала "Stroke (Инсульт)"

2012 ··2011 ··2010 ··2009 ··2008 ··2007 ··2005 ··2004

№1

№2

№3

№4

№5

№6

№7

№8

№9

№10

№11

№12

Журнал "Stroke (Инсульт)" №4, 2012

Влияние очаговой ишемии на длинные некодирующие РНК

А. Дарап, В.П. Накка, Р. Вемуганти

Предпосылки и цель исследования. Длинные некодирующие РНК (днРНК) играют важную роль в физиологии клеток. Оценили влияние очаговой ишемии на экспрессию 8314 днРНК в коре головного мозга у крыс с использованием микрочипов. Методы. Ишемию индуцировали путем транзиторной окклюзии средней мозговой артерии. С помощью методов биоинформатики изучили геномные и транскриптомные корреляты чувствительных к инсульту днРНК и участки связывания транскрипционных факторов на их промоторах. Результаты. Через 3–12 часов реперфузии после окклюзии средней мозговой артерии зарегистрировали повышение экспрессии 359 днРНК (более чем в 2 раза) и ее снижение для 84 днРНК (более чем в 0,5 раза) по сравнению с контрольной группой. У шестидесяти двух чувствительных к инсульту днРНК обнаружили >90% последовательностей, гомологичных экзонам генов, кодирующих белок. Обнаружили высокое совпадение участков связывания транскрипционных факторов у промоторов чувствительных к инсульту днРНК и их гомологичных генов, кодирующих белок. Несмотря на наличие открытых рамок считывания, при трансляции in vitro днРНК не синтезировали какой-либо субстрат. Выводы. При инсульте в значительной степени нарушается профиль церебральной экспрессии днРНК. Более 90% генома млекопитающих транскрибируется в некодирующие РНК, которые играют важнейшую роль в клеточном гомеостазе. Недавно продемонстрировали, что при инсульте у крыс изменяются церебральные профили микроРНК и РНК, взаимодействующих по piwi-типу. В дополнение к этим маленьким некодирующим РНК, геном транскрибирует множество днРНК (нРНК; >200 нуклеотидов), контролирующих ориентацию белков на геномные локусы, эпигенетический сайленсинг, и служащих в качестве ядерного скелета для некоторых белков. Предположительно, нРНК играют важную роль в патофизиологии болезни Альцгеймера и опухолей головного мозга. В настоящей работе оценили влияние очаговой ишемии на кортикальные профили экспрессии днРНК. Ключевые слова: мимикрия экзонов (exon mimicry), некодирующая РНК (noncoding RNA), инсульт (stroke), транскрипционный фактор (transcription factor)

Вернуться к списку материалов номера №4

Полное или частичное использование материалов журнала "Stroke" возможно только с разрешения Издателя.